自2014年起，保健食品合格率不断提高。国家市场监管总局公布的2021年度食品安全监督抽检情况统计显示，2021年，全国市场监管部门共完成针对保健食品的食品安全监督抽检37228批次，保健食品抽检合格率达到99.58%。保健食品抽检合格率在全
国家市场监管总局特殊食品信息平台的数据显示，截至2022年8月，共有19474个注册类保健食品，平均每年批准约600个。其中，2021年批准注册的国产保健食品有274个，今年已批准注册的国产保健食品有121个。
截至2021年2月10日，我国保健食品备案数量达到1万多个。其中，2021年发放3088个备案凭证。截至2022年7月5日，今年已发放1483个备案凭证。
国家市场监管总局特殊食品司司长周石平表示，保健食品注册备案“双轨制”有序运行，逐步形成了原料目录管理、功能声称目录管理、注册备案管理等较为完备的监管制度体系。在改革推进过程中，要不断顺应时代发展要求，在监管方式、方法手段上改革创新，持续发挥传统有效监管手段作用的同时，积极探索运用信用监管、智慧监管等手段，有效提升监管效能。
保健食品是我国健康产业的重要组成部分。近年来，各级市场监管部门持续开展保健食品行业专项清理整治行动，坚决落实“四个最严”要求，保健食品质量安全水平显著提升，市场秩序明显改善。2014—2021年，我国保健食品抽检合格率从93%提升到99%以上。多年来，我国在保健食品的监管中积累了大量经验，通过管理创新、制度创新、方法创新等手段，进一步促进保健食品产业加快实现从“发展中规范”向“规范中发展”转变。
中国营养保健食品协会执行副会长厉梁秋表示，伴随着行业政策的红利，目前保健食品注册备案“双轨制”持续深化改革，新功能、新原料探讨逐步提上日程，保健食品需求呈现多元化增长趋势。
业内人士认为，从保健食品注册“单轨制”向注册备案“双轨制”的转变，有力提升市场准入监管效能的同时，也有效实现市场主体备案便利化，是“双轨制”改革的一大突破。
2019年，国家市场监管总局会同国家卫生健康委制定并发布的《保健食品原料目录与保健功能目录管理办法》施行，为“双轨制”落地提供制度保障。此后，我国相关部门加快推进保健食品注册和备案“双轨制”运行，建立开放多元的保健食品目录管理制度，以原料目录和功能目录为抓手，进一步强化了产管并重、社会共治。
2016年实施的《保健食品注册与备案管理办法》，让保健食品注册和备案“双轨”并行。该办法将原来单一注册制调整为注册与备案相结合的管理模式，对使用原料已经列入保健食品原料目录的保健食品，以及首次进口的属于补充维生素、矿物质等营养物质的保健食品实行备案管理。
目前，我国保健食品准入制度正在形成“注册审批是少数、备案是多数”的监管新格局。近年来，在我国32个食品生产许可类别中，疫情因素让消费者更加关注自身健康，成为保健食品市场发展的源头活水。直播、短视频等新模式也推动了保健食品产业快速发展。线上保健食品销售规模快速增长，中国保健协会保健咨询服务工作委员会秘书长王鹤松表示，尤其是政策层面实施的“双轨制”改革，但保健食品作为我国健康产业的重要组成部分，保健食品市场规模较小，我国保健食品领域利好消息不断，在增强国民体质、减少医疗开支、拉动内需、扩大就业、增加税收、促进国民经济发展等方面发挥着不可替代的作用。相对于其他规模较大类别的食品行业而言，
